Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
FOXE3Q13461 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
FOXE3Q13461 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
FOXE3Q13461 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
FOXE3Q13461 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
FOXE3Q13461 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
FOXE3Q13461 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
FOXE3Q13461 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
FOXE3Q13461 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
FOXE3Q13461 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
FOXE3Q13461 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
FOXE3Q13461 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
FOXE3Q13461 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
FOXE3Q13461 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
FOXE3Q13461 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
FOXE3Q13461 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
FOXE3Q13461 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
FOXE3Q13461 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
FOXE3Q13461 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
FOXE3Q13461 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
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FOXE3Q13461 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
FOXE3Q13461 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
FOXE3Q13461 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
FOXE3Q13461 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
FOXE3Q13461 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
FOXE3Q13461 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
FOXE3Q13461 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
FOXE3Q13461 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
FOXE3Q13461 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
FOXE3Q13461 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
FOXE3Q13461 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
FOXE3Q13461 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
FOXE3Q13461 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
FOXE3Q13461 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
FOXE3Q13461 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
FOXE3Q13461 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
FOXE3Q13461 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
FOXE3Q13461 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
FOXE3Q13461 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
FOXE3Q13461 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
FOXE3Q13461 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
FOXE3Q13461 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
FOXE3Q13461 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.09□□□□□ -2.4
FOXE3Q13461 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
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FOXE3Q13461 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
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FOXE3Q13461 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0□□□□□ -2.41
FOXE3Q13461 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC0□□□□□ -2.41
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FOXE3Q13461 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC0□□□□□ -2.41
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FOXE3Q13461 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
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FOXE3Q13461 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
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FOXE3Q13461 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
FOXE3Q13461 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
FOXE3Q13461 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
FOXE3Q13461 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
FOXE3Q13461 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
FOXE3Q13461 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
FOXE3Q13461 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
FOXE3Q13461 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
FOXE3Q13461 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
FOXE3Q13461 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
FOXE3Q13461 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
FOXE3Q13461 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
FOXE3Q13461 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
FOXE3Q13461 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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