Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
IFT88Q13099 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
IFT88Q13099 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
IFT88Q13099 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
IFT88Q13099 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
IFT88Q13099 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
IFT88Q13099 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
IFT88Q13099 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
IFT88Q13099 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
IFT88Q13099 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
IFT88Q13099 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
IFT88Q13099 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
IFT88Q13099 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
IFT88Q13099 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
IFT88Q13099 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
IFT88Q13099 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
IFT88Q13099 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
IFT88Q13099 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
IFT88Q13099 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
IFT88Q13099 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
IFT88Q13099 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
IFT88Q13099 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
IFT88Q13099 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
IFT88Q13099 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
IFT88Q13099 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
IFT88Q13099 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
IFT88Q13099 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
IFT88Q13099 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
IFT88Q13099 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
IFT88Q13099 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
IFT88Q13099 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
IFT88Q13099 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
IFT88Q13099 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
IFT88Q13099 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
IFT88Q13099 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
IFT88Q13099 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
IFT88Q13099 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
IFT88Q13099 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
IFT88Q13099 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
IFT88Q13099 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
IFT88Q13099 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
IFT88Q13099 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
IFT88Q13099 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
IFT88Q13099 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
IFT88Q13099 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
IFT88Q13099 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.41□□□□□ -2.64
IFT88Q13099 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
IFT88Q13099 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
IFT88Q13099 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
IFT88Q13099 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
IFT88Q13099 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
IFT88Q13099 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
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IFT88Q13099 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
IFT88Q13099 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
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IFT88Q13099 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
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IFT88Q13099 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
IFT88Q13099 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
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IFT88Q13099 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
IFT88Q13099 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
IFT88Q13099 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
IFT88Q13099 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
IFT88Q13099 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
IFT88Q13099 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
IFT88Q13099 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
IFT88Q13099 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
IFT88Q13099 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
IFT88Q13099 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
IFT88Q13099 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
IFT88Q13099 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
IFT88Q13099 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
IFT88Q13099 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
IFT88Q13099 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
IFT88Q13099 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
IFT88Q13099 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
IFT88Q13099 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
IFT88Q13099 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
IFT88Q13099 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
IFT88Q13099 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
IFT88Q13099 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
IFT88Q13099 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
IFT88Q13099 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
IFT88Q13099 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
IFT88Q13099 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
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