Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
LTBRP36941 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
LTBRP36941 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
LTBRP36941 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
LTBRP36941 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
LTBRP36941 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
LTBRP36941 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
LTBRP36941 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
LTBRP36941 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
LTBRP36941 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
LTBRP36941 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
LTBRP36941 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
LTBRP36941 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
LTBRP36941 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
LTBRP36941 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC0□□□□□ -2.41
LTBRP36941 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC0□□□□□ -2.41
LTBRP36941 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC0□□□□□ -2.41
LTBRP36941 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC0□□□□□ -2.41
LTBRP36941 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC0□□□□□ -2.41
LTBRP36941 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC0□□□□□ -2.41
LTBRP36941 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
LTBRP36941 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
LTBRP36941 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
LTBRP36941 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
LTBRP36941 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
LTBRP36941 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
LTBRP36941 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
LTBRP36941 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LTBRP36941 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LTBRP36941 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LTBRP36941 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LTBRP36941 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LTBRP36941 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LTBRP36941 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LTBRP36941 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LTBRP36941 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
LTBRP36941 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
LTBRP36941 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
LTBRP36941 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
LTBRP36941 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
LTBRP36941 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
LTBRP36941 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
LTBRP36941 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
LTBRP36941 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
LTBRP36941 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
LTBRP36941 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
LTBRP36941 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
LTBRP36941 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
LTBRP36941 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LTBRP36941 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LTBRP36941 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LTBRP36941 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LTBRP36941 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LTBRP36941 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LTBRP36941 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LTBRP36941 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LTBRP36941 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LTBRP36941 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LTBRP36941 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LTBRP36941 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LTBRP36941 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LTBRP36941 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LTBRP36941 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LTBRP36941 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
LTBRP36941 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
LTBRP36941 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
LTBRP36941 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
LTBRP36941 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
LTBRP36941 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
LTBRP36941 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
LTBRP36941 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
LTBRP36941 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
LTBRP36941 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
LTBRP36941 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
LTBRP36941 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
LTBRP36941 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
LTBRP36941 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
LTBRP36941 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
LTBRP36941 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
LTBRP36941 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
LTBRP36941 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
LTBRP36941 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
LTBRP36941 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
LTBRP36941 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
LTBRP36941 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
LTBRP36941 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
LTBRP36941 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
LTBRP36941 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
LTBRP36941 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
LTBRP36941 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
LTBRP36941 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
LTBRP36941 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
LTBRP36941 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
LTBRP36941 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
LTBRP36941 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
LTBRP36941 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
LTBRP36941 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
LTBRP36941 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
LTBRP36941 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
LTBRP36941 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.1 ms