Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRERF1Q96PN7 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRERF1Q96PN7 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRERF1Q96PN7 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRERF1Q96PN7 U6.103-201ENST00000637085 61 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRERF1Q96PN7 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
TRERF1Q96PN7 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TRERF1Q96PN7 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TRERF1Q96PN7 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TRERF1Q96PN7 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TRERF1Q96PN7 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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TRERF1Q96PN7 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TRERF1Q96PN7 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TRERF1Q96PN7 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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TRERF1Q96PN7 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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TRERF1Q96PN7 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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TRERF1Q96PN7 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TRERF1Q96PN7 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TRERF1Q96PN7 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TRERF1Q96PN7 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TRERF1Q96PN7 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TRERF1Q96PN7 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TRERF1Q96PN7 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
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TRERF1Q96PN7 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TRERF1Q96PN7 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TRERF1Q96PN7 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TRERF1Q96PN7 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TRERF1Q96PN7 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TRERF1Q96PN7 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TRERF1Q96PN7 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
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TRERF1Q96PN7 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
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TRERF1Q96PN7 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
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TRERF1Q96PN7 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
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TRERF1Q96PN7 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRERF1Q96PN7 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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TRERF1Q96PN7 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
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TRERF1Q96PN7 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
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TRERF1Q96PN7 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
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TRERF1Q96PN7 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRERF1Q96PN7 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRERF1Q96PN7 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRERF1Q96PN7 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRERF1Q96PN7 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRERF1Q96PN7 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRERF1Q96PN7 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRERF1Q96PN7 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRERF1Q96PN7 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRERF1Q96PN7 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
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