Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
HDAC1Q13547 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HDAC1Q13547 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HDAC1Q13547 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HDAC1Q13547 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HDAC1Q13547 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HDAC1Q13547 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HDAC1Q13547 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HDAC1Q13547 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HDAC1Q13547 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HDAC1Q13547 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HDAC1Q13547 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.24□□□□□ -2.45
HDAC1Q13547 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HDAC1Q13547 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HDAC1Q13547 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HDAC1Q13547 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HDAC1Q13547 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HDAC1Q13547 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HDAC1Q13547 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HDAC1Q13547 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HDAC1Q13547 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HDAC1Q13547 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HDAC1Q13547 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HDAC1Q13547 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HDAC1Q13547 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HDAC1Q13547 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HDAC1Q13547 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HDAC1Q13547 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HDAC1Q13547 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HDAC1Q13547 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HDAC1Q13547 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HDAC1Q13547 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HDAC1Q13547 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HDAC1Q13547 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
HDAC1Q13547 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
HDAC1Q13547 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
HDAC1Q13547 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
HDAC1Q13547 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
HDAC1Q13547 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HDAC1Q13547 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HDAC1Q13547 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HDAC1Q13547 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HDAC1Q13547 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HDAC1Q13547 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HDAC1Q13547 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HDAC1Q13547 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HDAC1Q13547 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HDAC1Q13547 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HDAC1Q13547 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HDAC1Q13547 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HDAC1Q13547 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HDAC1Q13547 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HDAC1Q13547 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HDAC1Q13547 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
HDAC1Q13547 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HDAC1Q13547 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HDAC1Q13547 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HDAC1Q13547 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HDAC1Q13547 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HDAC1Q13547 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HDAC1Q13547 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HDAC1Q13547 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HDAC1Q13547 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HDAC1Q13547 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HDAC1Q13547 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HDAC1Q13547 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HDAC1Q13547 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HDAC1Q13547 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HDAC1Q13547 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HDAC1Q13547 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HDAC1Q13547 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HDAC1Q13547 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HDAC1Q13547 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HDAC1Q13547 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HDAC1Q13547 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HDAC1Q13547 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HDAC1Q13547 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HDAC1Q13547 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HDAC1Q13547 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HDAC1Q13547 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HDAC1Q13547 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HDAC1Q13547 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HDAC1Q13547 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HDAC1Q13547 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HDAC1Q13547 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HDAC1Q13547 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HDAC1Q13547 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HDAC1Q13547 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HDAC1Q13547 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
HDAC1Q13547 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
HDAC1Q13547 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
HDAC1Q13547 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
HDAC1Q13547 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HDAC1Q13547 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HDAC1Q13547 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HDAC1Q13547 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HDAC1Q13547 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HDAC1Q13547 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HDAC1Q13547 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HDAC1Q13547 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms