Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PGGT1BP53609 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PGGT1BP53609 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PGGT1BP53609 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
PGGT1BP53609 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PGGT1BP53609 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PGGT1BP53609 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PGGT1BP53609 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PGGT1BP53609 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PGGT1BP53609 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PGGT1BP53609 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PGGT1BP53609 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
PGGT1BP53609 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PGGT1BP53609 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PGGT1BP53609 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PGGT1BP53609 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PGGT1BP53609 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PGGT1BP53609 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PGGT1BP53609 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PGGT1BP53609 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PGGT1BP53609 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PGGT1BP53609 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PGGT1BP53609 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PGGT1BP53609 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PGGT1BP53609 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PGGT1BP53609 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PGGT1BP53609 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PGGT1BP53609 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PGGT1BP53609 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PGGT1BP53609 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PGGT1BP53609 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
PGGT1BP53609 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PGGT1BP53609 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PGGT1BP53609 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PGGT1BP53609 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PGGT1BP53609 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PGGT1BP53609 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
PGGT1BP53609 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PGGT1BP53609 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PGGT1BP53609 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PGGT1BP53609 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PGGT1BP53609 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PGGT1BP53609 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PGGT1BP53609 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
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PGGT1BP53609 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
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PGGT1BP53609 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PGGT1BP53609 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PGGT1BP53609 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PGGT1BP53609 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PGGT1BP53609 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
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PGGT1BP53609 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PGGT1BP53609 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
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PGGT1BP53609 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
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PGGT1BP53609 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
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PGGT1BP53609 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
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PGGT1BP53609 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
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PGGT1BP53609 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
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PGGT1BP53609 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PGGT1BP53609 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PGGT1BP53609 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PGGT1BP53609 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PGGT1BP53609 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PGGT1BP53609 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PGGT1BP53609 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
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