Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

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Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.09□□□□□ -2.39
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VAMP4O75379 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VAMP4O75379 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
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VAMP4O75379 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VAMP4O75379 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
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VAMP4O75379 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
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VAMP4O75379 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
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VAMP4O75379 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
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VAMP4O75379 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
VAMP4O75379 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.04□□□□□ -2.4
VAMP4O75379 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
VAMP4O75379 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
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VAMP4O75379 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
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VAMP4O75379 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
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