Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.09□□□□□ -2.39
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VAMP4O75379 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.09□□□□□ -2.4
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VAMP4O75379 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
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VAMP4O75379 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VAMP4O75379 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
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VAMP4O75379 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VAMP4O75379 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
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VAMP4O75379 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
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VAMP4O75379 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
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VAMP4O75379 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
VAMP4O75379 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
VAMP4O75379 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
VAMP4O75379 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
VAMP4O75379 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.04□□□□□ -2.4
VAMP4O75379 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
VAMP4O75379 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
VAMP4O75379 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
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VAMP4O75379 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
VAMP4O75379 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
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VAMP4O75379 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
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VAMP4O75379 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
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VAMP4O75379 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
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