Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ERVV-2B6SEH9 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ERVV-2B6SEH9 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ERVV-2B6SEH9 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ERVV-2B6SEH9 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ERVV-2B6SEH9 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ERVV-2B6SEH9 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ERVV-2B6SEH9 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
ERVV-2B6SEH9 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
ERVV-2B6SEH9 RNU6-59P-201ENST00000384787 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ERVV-2B6SEH9 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ERVV-2B6SEH9 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ERVV-2B6SEH9 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ERVV-2B6SEH9 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ERVV-2B6SEH9 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ERVV-2B6SEH9 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ERVV-2B6SEH9 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ERVV-2B6SEH9 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ERVV-2B6SEH9 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ERVV-2B6SEH9 U6.103-201ENST00000637085 61 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ERVV-2B6SEH9 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERVV-2B6SEH9 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERVV-2B6SEH9 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERVV-2B6SEH9 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERVV-2B6SEH9 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERVV-2B6SEH9 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERVV-2B6SEH9 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERVV-2B6SEH9 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERVV-2B6SEH9 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ERVV-2B6SEH9 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ERVV-2B6SEH9 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ERVV-2B6SEH9 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ERVV-2B6SEH9 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ERVV-2B6SEH9 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ERVV-2B6SEH9 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ERVV-2B6SEH9 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ERVV-2B6SEH9 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ERVV-2B6SEH9 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ERVV-2B6SEH9 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ERVV-2B6SEH9 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ERVV-2B6SEH9 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ERVV-2B6SEH9 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ERVV-2B6SEH9 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ERVV-2B6SEH9 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ERVV-2B6SEH9 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
ERVV-2B6SEH9 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ERVV-2B6SEH9 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ERVV-2B6SEH9 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
ERVV-2B6SEH9 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ERVV-2B6SEH9 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ERVV-2B6SEH9 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ERVV-2B6SEH9 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ERVV-2B6SEH9 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ERVV-2B6SEH9 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ERVV-2B6SEH9 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ERVV-2B6SEH9 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
ERVV-2B6SEH9 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ERVV-2B6SEH9 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ERVV-2B6SEH9 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ERVV-2B6SEH9 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ERVV-2B6SEH9 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ERVV-2B6SEH9 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ERVV-2B6SEH9 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ERVV-2B6SEH9 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ERVV-2B6SEH9 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ERVV-2B6SEH9 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ERVV-2B6SEH9 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ERVV-2B6SEH9 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ERVV-2B6SEH9 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ERVV-2B6SEH9 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ERVV-2B6SEH9 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ERVV-2B6SEH9 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ERVV-2B6SEH9 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ERVV-2B6SEH9 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ERVV-2B6SEH9 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ERVV-2B6SEH9 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ERVV-2B6SEH9 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ERVV-2B6SEH9 RNU6-894P-201ENST00000517094 105 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ERVV-2B6SEH9 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ERVV-2B6SEH9 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ERVV-2B6SEH9 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ERVV-2B6SEH9 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ERVV-2B6SEH9 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ERVV-2B6SEH9 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ERVV-2B6SEH9 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 419.6 ms