Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
SCN8AQ9UQD0 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
SCN8AQ9UQD0 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
SCN8AQ9UQD0 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
SCN8AQ9UQD0 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SCN8AQ9UQD0 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SCN8AQ9UQD0 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SCN8AQ9UQD0 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SCN8AQ9UQD0 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SCN8AQ9UQD0 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
SCN8AQ9UQD0 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
SCN8AQ9UQD0 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
SCN8AQ9UQD0 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
SCN8AQ9UQD0 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
SCN8AQ9UQD0 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
SCN8AQ9UQD0 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
SCN8AQ9UQD0 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
SCN8AQ9UQD0 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
SCN8AQ9UQD0 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
SCN8AQ9UQD0 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
SCN8AQ9UQD0 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
SCN8AQ9UQD0 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
SCN8AQ9UQD0 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
SCN8AQ9UQD0 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
SCN8AQ9UQD0 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
SCN8AQ9UQD0 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
SCN8AQ9UQD0 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.82
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.82
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.82
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.82
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.82
SCN8AQ9UQD0 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.82
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
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