Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
SCN8AQ9UQD0 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
SCN8AQ9UQD0 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
SCN8AQ9UQD0 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
SCN8AQ9UQD0 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SCN8AQ9UQD0 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SCN8AQ9UQD0 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SCN8AQ9UQD0 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SCN8AQ9UQD0 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SCN8AQ9UQD0 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
SCN8AQ9UQD0 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
SCN8AQ9UQD0 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
SCN8AQ9UQD0 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
SCN8AQ9UQD0 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
SCN8AQ9UQD0 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
SCN8AQ9UQD0 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
SCN8AQ9UQD0 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
SCN8AQ9UQD0 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
SCN8AQ9UQD0 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
SCN8AQ9UQD0 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
SCN8AQ9UQD0 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
SCN8AQ9UQD0 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
SCN8AQ9UQD0 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
SCN8AQ9UQD0 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
SCN8AQ9UQD0 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
SCN8AQ9UQD0 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
SCN8AQ9UQD0 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.82
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.82
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.82
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.82
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.82
SCN8AQ9UQD0 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.82
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 183.5 ms