Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HERPUD2Q9BSE4 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HERPUD2Q9BSE4 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HERPUD2Q9BSE4 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HERPUD2Q9BSE4 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HERPUD2Q9BSE4 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HERPUD2Q9BSE4 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.26□□□□□ -2.37
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HERPUD2Q9BSE4 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HERPUD2Q9BSE4 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HERPUD2Q9BSE4 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HERPUD2Q9BSE4 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HERPUD2Q9BSE4 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HERPUD2Q9BSE4 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HERPUD2Q9BSE4 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HERPUD2Q9BSE4 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HERPUD2Q9BSE4 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HERPUD2Q9BSE4 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HERPUD2Q9BSE4 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HERPUD2Q9BSE4 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HERPUD2Q9BSE4 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HERPUD2Q9BSE4 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HERPUD2Q9BSE4 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HERPUD2Q9BSE4 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HERPUD2Q9BSE4 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HERPUD2Q9BSE4 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HERPUD2Q9BSE4 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HERPUD2Q9BSE4 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HERPUD2Q9BSE4 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HERPUD2Q9BSE4 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HERPUD2Q9BSE4 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HERPUD2Q9BSE4 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HERPUD2Q9BSE4 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HERPUD2Q9BSE4 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HERPUD2Q9BSE4 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HERPUD2Q9BSE4 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HERPUD2Q9BSE4 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HERPUD2Q9BSE4 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HERPUD2Q9BSE4 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HERPUD2Q9BSE4 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HERPUD2Q9BSE4 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HERPUD2Q9BSE4 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HERPUD2Q9BSE4 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HERPUD2Q9BSE4 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HERPUD2Q9BSE4 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HERPUD2Q9BSE4 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HERPUD2Q9BSE4 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HERPUD2Q9BSE4 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HERPUD2Q9BSE4 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HERPUD2Q9BSE4 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HERPUD2Q9BSE4 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HERPUD2Q9BSE4 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HERPUD2Q9BSE4 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HERPUD2Q9BSE4 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HERPUD2Q9BSE4 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HERPUD2Q9BSE4 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HERPUD2Q9BSE4 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HERPUD2Q9BSE4 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HERPUD2Q9BSE4 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HERPUD2Q9BSE4 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HERPUD2Q9BSE4 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HERPUD2Q9BSE4 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HERPUD2Q9BSE4 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HERPUD2Q9BSE4 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HERPUD2Q9BSE4 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HERPUD2Q9BSE4 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HERPUD2Q9BSE4 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HERPUD2Q9BSE4 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HERPUD2Q9BSE4 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HERPUD2Q9BSE4 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HERPUD2Q9BSE4 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HERPUD2Q9BSE4 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HERPUD2Q9BSE4 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HERPUD2Q9BSE4 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HERPUD2Q9BSE4 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HERPUD2Q9BSE4 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 222.5 ms