Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TRERF1Q96PN7 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TRERF1Q96PN7 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TRERF1Q96PN7 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TRERF1Q96PN7 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TRERF1Q96PN7 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
TRERF1Q96PN7 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TRERF1Q96PN7 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
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TRERF1Q96PN7 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
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TRERF1Q96PN7 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TRERF1Q96PN7 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TRERF1Q96PN7 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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TRERF1Q96PN7 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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TRERF1Q96PN7 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
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TRERF1Q96PN7 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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TRERF1Q96PN7 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TRERF1Q96PN7 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TRERF1Q96PN7 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TRERF1Q96PN7 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TRERF1Q96PN7 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TRERF1Q96PN7 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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TRERF1Q96PN7 RNU6-724P-201ENST00000390958 105 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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TRERF1Q96PN7 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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TRERF1Q96PN7 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TRERF1Q96PN7 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TRERF1Q96PN7 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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TRERF1Q96PN7 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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TRERF1Q96PN7 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
TRERF1Q96PN7 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TRERF1Q96PN7 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TRERF1Q96PN7 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TRERF1Q96PN7 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TRERF1Q96PN7 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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TRERF1Q96PN7 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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