Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-3.85□□□□□ -3.03
UBR3Q6ZT12 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC-3.85□□□□□ -3.03
UBR3Q6ZT12 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
UBR3Q6ZT12 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
UBR3Q6ZT12 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC-3.86□□□□□ -3.03
UBR3Q6ZT12 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
UBR3Q6ZT12 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
UBR3Q6ZT12 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
UBR3Q6ZT12 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
UBR3Q6ZT12 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
UBR3Q6ZT12 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
UBR3Q6ZT12 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
UBR3Q6ZT12 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
UBR3Q6ZT12 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
UBR3Q6ZT12 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
UBR3Q6ZT12 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
UBR3Q6ZT12 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
UBR3Q6ZT12 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
UBR3Q6ZT12 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
UBR3Q6ZT12 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
UBR3Q6ZT12 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.04
UBR3Q6ZT12 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.04
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.04
UBR3Q6ZT12 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.04
UBR3Q6ZT12 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.04
UBR3Q6ZT12 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
UBR3Q6ZT12 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
UBR3Q6ZT12 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
UBR3Q6ZT12 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
UBR3Q6ZT12 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
UBR3Q6ZT12 RNU6-665P-201ENST00000384639 107 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
UBR3Q6ZT12 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
UBR3Q6ZT12 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
UBR3Q6ZT12 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
UBR3Q6ZT12 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
UBR3Q6ZT12 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
UBR3Q6ZT12 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
UBR3Q6ZT12 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
UBR3Q6ZT12 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
UBR3Q6ZT12 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
UBR3Q6ZT12 AL359920.1-201ENST00000618332 176 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.05
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.05
UBR3Q6ZT12 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
UBR3Q6ZT12 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
UBR3Q6ZT12 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
UBR3Q6ZT12 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
UBR3Q6ZT12 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
UBR3Q6ZT12 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
UBR3Q6ZT12 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
UBR3Q6ZT12 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
UBR3Q6ZT12 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
UBR3Q6ZT12 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
UBR3Q6ZT12 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
UBR3Q6ZT12 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
UBR3Q6ZT12 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
UBR3Q6ZT12 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
UBR3Q6ZT12 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
UBR3Q6ZT12 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
UBR3Q6ZT12 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
UBR3Q6ZT12 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
UBR3Q6ZT12 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
UBR3Q6ZT12 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
UBR3Q6ZT12 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.663-201ENST00000516043 101 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
UBR3Q6ZT12 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
UBR3Q6ZT12 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
UBR3Q6ZT12 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
UBR3Q6ZT12 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
UBR3Q6ZT12 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
UBR3Q6ZT12 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
UBR3Q6ZT12 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
UBR3Q6ZT12 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
UBR3Q6ZT12 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
UBR3Q6ZT12 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.5 ms