Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ANKRD39Q53RE8 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ANKRD39Q53RE8 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ANKRD39Q53RE8 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ANKRD39Q53RE8 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ANKRD39Q53RE8 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ANKRD39Q53RE8 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ANKRD39Q53RE8 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ANKRD39Q53RE8 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ANKRD39Q53RE8 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ANKRD39Q53RE8 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ANKRD39Q53RE8 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ANKRD39Q53RE8 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ANKRD39Q53RE8 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ANKRD39Q53RE8 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ANKRD39Q53RE8 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ANKRD39Q53RE8 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ANKRD39Q53RE8 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ANKRD39Q53RE8 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ANKRD39Q53RE8 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ANKRD39Q53RE8 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ANKRD39Q53RE8 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ANKRD39Q53RE8 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ANKRD39Q53RE8 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ANKRD39Q53RE8 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ANKRD39Q53RE8 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ANKRD39Q53RE8 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ANKRD39Q53RE8 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ANKRD39Q53RE8 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.1□□□□□ -2.39
ANKRD39Q53RE8 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ANKRD39Q53RE8 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ANKRD39Q53RE8 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ANKRD39Q53RE8 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ANKRD39Q53RE8 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.08□□□□□ -2.4
ANKRD39Q53RE8 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ANKRD39Q53RE8 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ANKRD39Q53RE8 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ANKRD39Q53RE8 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ANKRD39Q53RE8 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ANKRD39Q53RE8 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ANKRD39Q53RE8 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ANKRD39Q53RE8 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ANKRD39Q53RE8 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ANKRD39Q53RE8 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ANKRD39Q53RE8 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ANKRD39Q53RE8 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ANKRD39Q53RE8 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ANKRD39Q53RE8 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ANKRD39Q53RE8 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ANKRD39Q53RE8 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ANKRD39Q53RE8 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ANKRD39Q53RE8 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ANKRD39Q53RE8 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ANKRD39Q53RE8 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ANKRD39Q53RE8 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ANKRD39Q53RE8 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ANKRD39Q53RE8 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ANKRD39Q53RE8 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ANKRD39Q53RE8 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ANKRD39Q53RE8 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ANKRD39Q53RE8 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ANKRD39Q53RE8 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ANKRD39Q53RE8 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ANKRD39Q53RE8 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ANKRD39Q53RE8 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ANKRD39Q53RE8 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ANKRD39Q53RE8 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ANKRD39Q53RE8 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ANKRD39Q53RE8 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ANKRD39Q53RE8 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ANKRD39Q53RE8 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ANKRD39Q53RE8 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ANKRD39Q53RE8 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ANKRD39Q53RE8 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ANKRD39Q53RE8 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ANKRD39Q53RE8 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ANKRD39Q53RE8 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
ANKRD39Q53RE8 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ANKRD39Q53RE8 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ANKRD39Q53RE8 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ANKRD39Q53RE8 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ANKRD39Q53RE8 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ANKRD39Q53RE8 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ANKRD39Q53RE8 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 195.2 ms