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Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4
BBS9, Protein PTHB1, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
BBS9
Q3SYG4
RNU6-698P-201
ENST00000363523
107 nt
BASIC
0.48
□□□□□ -2.33
BBS9
Q3SYG4
RNU6-34P-201
ENST00000364874
107 nt
BASIC
0.48
□□□□□ -2.33
BBS9
Q3SYG4
RNU6-669P-201
ENST00000365575
107 nt
BASIC
0.48
□□□□□ -2.33
BBS9
Q3SYG4
MIR9-2-201
ENST00000384838
87 nt
BASIC
0.48
□□□□□ -2.33
BBS9
Q3SYG4
AC110620.1-201
ENST00000416042
228 nt
BASIC
0.48
□□□□□ -2.33
BBS9
Q3SYG4
MIR6773-201
ENST00000612812
74 nt
BASIC
0.48
□□□□□ -2.33
BBS9
Q3SYG4
AC243829.3-201
ENST00000622177
108 nt
BASIC
0.48
□□□□□ -2.33
BBS9
Q3SYG4
RNU6-127P-201
ENST00000390897
107 nt
BASIC
0.47
□□□□□ -2.33
BBS9
Q3SYG4
SNORD113-2-201
ENST00000391082
72 nt
BASIC
0.47
□□□□□ -2.33
BBS9
Q3SYG4
AL021921.1-201
ENST00000442774
93 nt
BASIC
0.47
□□□□□ -2.33
BBS9
Q3SYG4
RNU6-782P-201
ENST00000516852
104 nt
BASIC
0.47
□□□□□ -2.33
BBS9
Q3SYG4
PVT1_3.1-201
ENST00000620853
95 nt
BASIC
0.47
□□□□□ -2.33
BBS9
Q3SYG4
AC090625.1-201
ENST00000357130
210 nt
BASIC
0.46
□□□□□ -2.34
BBS9
Q3SYG4
SNORD115-25-201
ENST00000362619
82 nt
BASIC
0.46
□□□□□ -2.34
BBS9
Q3SYG4
SNORA25.5-201
ENST00000363782
126 nt
BASIC
0.46
□□□□□ -2.34
BBS9
Q3SYG4
SNORA50A-201
ENST00000384225
134 nt
BASIC
0.46
□□□□□ -2.34
BBS9
Q3SYG4
MIR106A-201
ENST00000384870
81 nt
BASIC
0.45
□□□□□ -2.34
BBS9
Q3SYG4
MIR630-201
ENST00000384957
97 nt
BASIC
0.45
□□□□□ -2.34
BBS9
Q3SYG4
TRAJ9-201
ENST00000390528
61 nt
APPRIS P1
BASIC
0.45
□□□□□ -2.34
BBS9
Q3SYG4
AC090617.8-201
ENST00000623339
167 nt
BASIC
0.45
□□□□□ -2.34
BBS9
Q3SYG4
MIR643-201
ENST00000385267
97 nt
BASIC
0.44
□□□□□ -2.34
BBS9
Q3SYG4
MIR1255B2-201
ENST00000408618
67 nt
BASIC
0.44
□□□□□ -2.34
BBS9
Q3SYG4
AC114737.2-201
ENST00000421583
173 nt
BASIC
0.44
□□□□□ -2.34
BBS9
Q3SYG4
RNA5SP480-201
ENST00000516840
109 nt
BASIC
0.44
□□□□□ -2.34
BBS9
Q3SYG4
AC069113.3-201
ENST00000521019
150 nt
BASIC
0.44
□□□□□ -2.34
BBS9
Q3SYG4
RNU6-1327P-201
ENST00000365302
105 nt
BASIC
0.43
□□□□□ -2.34
BBS9
Q3SYG4
RNU6-337P-201
ENST00000391243
106 nt
BASIC
0.43
□□□□□ -2.34
BBS9
Q3SYG4
AC108740.1-201
ENST00000498629
225 nt
BASIC
0.43
□□□□□ -2.34
BBS9
Q3SYG4
RNA5SP436-201
ENST00000516020
115 nt
BASIC
0.43
□□□□□ -2.34
BBS9
Q3SYG4
RNU6-518P-201
ENST00000516056
96 nt
BASIC
0.43
□□□□□ -2.34
BBS9
Q3SYG4
RN7SL793P-201
ENST00000583259
296 nt
BASIC
0.43
□□□□□ -2.34
BBS9
Q3SYG4
RNU6-92P-201
ENST00000605893
104 nt
BASIC
0.43
□□□□□ -2.34
BBS9
Q3SYG4
KIF20B-201
ENST00000260753
6306 nt
APPRIS P3
TSL 1 (best)
BASIC
0.42
□□□□□ -2.34
BBS9
Q3SYG4
RNU6-502P-201
ENST00000362419
108 nt
BASIC
0.42
□□□□□ -2.34
BBS9
Q3SYG4
RNA5SP98-201
ENST00000363158
137 nt
BASIC
0.42
□□□□□ -2.34
BBS9
Q3SYG4
MIRLET7B-201
ENST00000385140
83 nt
BASIC
0.42
□□□□□ -2.34
BBS9
Q3SYG4
MIR936-201
ENST00000401264
98 nt
BASIC
0.42
□□□□□ -2.34
BBS9
Q3SYG4
MIR4711-201
ENST00000578274
70 nt
BASIC
0.42
□□□□□ -2.34
BBS9
Q3SYG4
RNU6-940P-201
ENST00000363433
104 nt
BASIC
0.41
□□□□□ -2.34
BBS9
Q3SYG4
SNORD114-26-201
ENST00000363543
72 nt
BASIC
0.41
□□□□□ -2.34
BBS9
Q3SYG4
RNA5SP192-201
ENST00000364404
120 nt
BASIC
0.41
□□□□□ -2.34
BBS9
Q3SYG4
Y_RNA.246-201
ENST00000364495
108 nt
BASIC
0.41
□□□□□ -2.34
BBS9
Q3SYG4
U4.4-201
ENST00000620626
117 nt
BASIC
0.41
□□□□□ -2.34
BBS9
Q3SYG4
SNORD114-23-201
ENST00000363536
72 nt
BASIC
0.4
□□□□□ -2.35
BBS9
Q3SYG4
RNA5SP470-201
ENST00000516463
106 nt
BASIC
0.4
□□□□□ -2.35
BBS9
Q3SYG4
RNU6ATAC22P-201
ENST00000516794
89 nt
BASIC
0.4
□□□□□ -2.35
BBS9
Q3SYG4
Y_RNA.540-201
ENST00000384638
111 nt
BASIC
0.39
□□□□□ -2.35
BBS9
Q3SYG4
RNU7-154P-201
ENST00000516194
62 nt
BASIC
0.39
□□□□□ -2.35
BBS9
Q3SYG4
AP000676.1-201
ENST00000533307
52 nt
BASIC
0.39
□□□□□ -2.35
BBS9
Q3SYG4
MIR892B-201
ENST00000401279
77 nt
BASIC
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□□□□□ -2.35
BBS9
Q3SYG4
VTRNA1-3-201
ENST00000365645
89 nt
BASIC
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□□□□□ -2.35
BBS9
Q3SYG4
RNA5SP193-201
ENST00000410353
107 nt
BASIC
0.37
□□□□□ -2.35
BBS9
Q3SYG4
MIR6514-201
ENST00000622549
70 nt
BASIC
0.37
□□□□□ -2.35
BBS9
Q3SYG4
MIR4315-1-201
ENST00000636800
73 nt
BASIC
0.37
□□□□□ -2.35
BBS9
Q3SYG4
AC010487.4-201
ENST00000637027
61 nt
BASIC
0.37
□□□□□ -2.35
BBS9
Q3SYG4
MIR4315-2-201
ENST00000640925
73 nt
BASIC
0.37
□□□□□ -2.35
BBS9
Q3SYG4
MIR193B-201
ENST00000384907
83 nt
BASIC
0.36
□□□□□ -2.35
BBS9
Q3SYG4
MIR519A2-201
ENST00000384990
87 nt
BASIC
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□□□□□ -2.35
BBS9
Q3SYG4
RNA5SP134-201
ENST00000516492
96 nt
BASIC
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□□□□□ -2.35
BBS9
Q3SYG4
RNU6-122P-201
ENST00000516818
107 nt
BASIC
0.36
□□□□□ -2.35
BBS9
Q3SYG4
RNA5SP325-201
ENST00000363756
130 nt
BASIC
0.35
□□□□□ -2.35
BBS9
Q3SYG4
SNORD60.1-201
ENST00000362451
73 nt
BASIC
0.34
□□□□□ -2.36
BBS9
Q3SYG4
MIR610-201
ENST00000385139
96 nt
BASIC
0.34
□□□□□ -2.36
BBS9
Q3SYG4
AC008883.1-201
ENST00000506562
193 nt
TSL 3
BASIC
0.34
□□□□□ -2.36
BBS9
Q3SYG4
CR383656.4-201
ENST00000546909
122 nt
BASIC
0.34
□□□□□ -2.36
BBS9
Q3SYG4
CEP290-203
ENST00000547691
5968 nt
TSL 1 (best)
BASIC
0.34
□□□□□ -2.36
BBS9
Q3SYG4
MIR148A-201
ENST00000362215
68 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
BBS9
Q3SYG4
Y_RNA.325-201
ENST00000365171
122 nt
BASIC
0.33
□□□□□ -2.36
BBS9
Q3SYG4
RNA5SP163-201
ENST00000410304
99 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
BBS9
Q3SYG4
MIR466-201
ENST00000580653
84 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
BBS9
Q3SYG4
RNU6-1246P-201
ENST00000391064
107 nt
BASIC
0.32
□□□□□ -2.36
BBS9
Q3SYG4
MIR4743-201
ENST00000584576
69 nt
BASIC
0.32
□□□□□ -2.36
BBS9
Q3SYG4
Y_RNA.74-201
ENST00000362911
99 nt
BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
BBS9
Q3SYG4
RNU6-499P-201
ENST00000365615
107 nt
BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
BBS9
Q3SYG4
MIR1273G-201
ENST00000577677
100 nt
BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
BBS9
Q3SYG4
snoR1.1-201
ENST00000628177
80 nt
BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
BBS9
Q3SYG4
MIR548H2-201
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88 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
BBS9
Q3SYG4
RNU6-180P-201
ENST00000516697
61 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
BBS9
Q3SYG4
HOTAIRM1_3.1-201
ENST00000619974
59 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
BBS9
Q3SYG4
SNORA42.1-201
ENST00000363515
137 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
BBS9
Q3SYG4
SNORD115-23-201
ENST00000364461
82 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
BBS9
Q3SYG4
MIR593-201
ENST00000384856
100 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
BBS9
Q3SYG4
RNU6ATAC29P-201
ENST00000408088
125 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
BBS9
Q3SYG4
AC104408.1-201
ENST00000605241
170 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
BBS9
Q3SYG4
MIR527-201
ENST00000385244
85 nt
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
BBS9
Q3SYG4
AL353803.5-201
ENST00000599815
141 nt
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
BBS9
Q3SYG4
MIR6779-201
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64 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
BBS9
Q3SYG4
MIR429-201
ENST00000362106
83 nt
BASIC
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BBS9
Q3SYG4
SNORD116-16-201
ENST00000384533
92 nt
BASIC
0.26
□□□□□ -2.37
BBS9
Q3SYG4
MIR633-201
ENST00000384821
98 nt
BASIC
0.26
□□□□□ -2.37
BBS9
Q3SYG4
RNU6-1133P-201
ENST00000410963
100 nt
BASIC
0.26
□□□□□ -2.37
BBS9
Q3SYG4
RNU7-159P-201
ENST00000459284
62 nt
BASIC
0.26
□□□□□ -2.37
BBS9
Q3SYG4
MIR3938-201
ENST00000582157
103 nt
BASIC
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□□□□□ -2.37
BBS9
Q3SYG4
MIR924-201
ENST00000638017
53 nt
BASIC
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□□□□□ -2.37
BBS9
Q3SYG4
RNU6-1079P-201
ENST00000362861
110 nt
BASIC
0.25
□□□□□ -2.37
BBS9
Q3SYG4
RNA5SP214-201
ENST00000363378
118 nt
BASIC
0.25
□□□□□ -2.37
BBS9
Q3SYG4
Y_RNA.282-201
ENST00000364793
102 nt
BASIC
0.25
□□□□□ -2.37
BBS9
Q3SYG4
RNU6-900P-201
ENST00000384498
102 nt
BASIC
0.25
□□□□□ -2.37
BBS9
Q3SYG4
SNORA41B-201
ENST00000384785
128 nt
BASIC
0.25
□□□□□ -2.37
BBS9
Q3SYG4
RNU7-55P-201
ENST00000459426
62 nt
BASIC
0.25
□□□□□ -2.37
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