Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PKN1Q16512 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PKN1Q16512 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PKN1Q16512 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PKN1Q16512 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PKN1Q16512 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PKN1Q16512 RNU6-724P-201ENST00000390958 105 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PKN1Q16512 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PKN1Q16512 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PKN1Q16512 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PKN1Q16512 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PKN1Q16512 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PKN1Q16512 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PKN1Q16512 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PKN1Q16512 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PKN1Q16512 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PKN1Q16512 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PKN1Q16512 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PKN1Q16512 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PKN1Q16512 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PKN1Q16512 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PKN1Q16512 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PKN1Q16512 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PKN1Q16512 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PKN1Q16512 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PKN1Q16512 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PKN1Q16512 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PKN1Q16512 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PKN1Q16512 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PKN1Q16512 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PKN1Q16512 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PKN1Q16512 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PKN1Q16512 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PKN1Q16512 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PKN1Q16512 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PKN1Q16512 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PKN1Q16512 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PKN1Q16512 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PKN1Q16512 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PKN1Q16512 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PKN1Q16512 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PKN1Q16512 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PKN1Q16512 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PKN1Q16512 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PKN1Q16512 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PKN1Q16512 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PKN1Q16512 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PKN1Q16512 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
PKN1Q16512 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PKN1Q16512 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PKN1Q16512 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PKN1Q16512 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PKN1Q16512 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PKN1Q16512 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PKN1Q16512 RNU6ATAC14P-201ENST00000516218 91 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PKN1Q16512 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PKN1Q16512 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PKN1Q16512 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PKN1Q16512 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PKN1Q16512 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PKN1Q16512 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PKN1Q16512 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PKN1Q16512 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PKN1Q16512 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PKN1Q16512 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PKN1Q16512 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PKN1Q16512 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PKN1Q16512 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PKN1Q16512 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PKN1Q16512 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PKN1Q16512 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PKN1Q16512 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PKN1Q16512 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PKN1Q16512 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PKN1Q16512 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
PKN1Q16512 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PKN1Q16512 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PKN1Q16512 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PKN1Q16512 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PKN1Q16512 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PKN1Q16512 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PKN1Q16512 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PKN1Q16512 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PKN1Q16512 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PKN1Q16512 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PKN1Q16512 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PKN1Q16512 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PKN1Q16512 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
PKN1Q16512 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PKN1Q16512 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PKN1Q16512 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PKN1Q16512 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PKN1Q16512 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PKN1Q16512 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
PKN1Q16512 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PKN1Q16512 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PKN1Q16512 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PKN1Q16512 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PKN1Q16512 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PKN1Q16512 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175 ms