Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
LAPTM4AQ15012 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
LAPTM4AQ15012 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
LAPTM4AQ15012 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
LAPTM4AQ15012 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
LAPTM4AQ15012 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
LAPTM4AQ15012 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
LAPTM4AQ15012 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
LAPTM4AQ15012 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
LAPTM4AQ15012 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
LAPTM4AQ15012 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
LAPTM4AQ15012 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
LAPTM4AQ15012 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
LAPTM4AQ15012 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
LAPTM4AQ15012 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
LAPTM4AQ15012 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
LAPTM4AQ15012 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
LAPTM4AQ15012 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
LAPTM4AQ15012 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
LAPTM4AQ15012 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
LAPTM4AQ15012 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
LAPTM4AQ15012 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
LAPTM4AQ15012 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
LAPTM4AQ15012 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
LAPTM4AQ15012 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
LAPTM4AQ15012 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
LAPTM4AQ15012 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
LAPTM4AQ15012 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
LAPTM4AQ15012 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
LAPTM4AQ15012 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
LAPTM4AQ15012 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
LAPTM4AQ15012 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
LAPTM4AQ15012 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
LAPTM4AQ15012 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
LAPTM4AQ15012 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
LAPTM4AQ15012 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
LAPTM4AQ15012 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
LAPTM4AQ15012 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
LAPTM4AQ15012 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
LAPTM4AQ15012 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
LAPTM4AQ15012 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
LAPTM4AQ15012 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
LAPTM4AQ15012 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
LAPTM4AQ15012 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
LAPTM4AQ15012 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
LAPTM4AQ15012 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
LAPTM4AQ15012 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
LAPTM4AQ15012 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
LAPTM4AQ15012 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
LAPTM4AQ15012 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
LAPTM4AQ15012 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.34□□□□□ -2.19
LAPTM4AQ15012 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
LAPTM4AQ15012 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
LAPTM4AQ15012 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LAPTM4AQ15012 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LAPTM4AQ15012 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LAPTM4AQ15012 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LAPTM4AQ15012 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LAPTM4AQ15012 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
LAPTM4AQ15012 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LAPTM4AQ15012 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LAPTM4AQ15012 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LAPTM4AQ15012 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LAPTM4AQ15012 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LAPTM4AQ15012 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LAPTM4AQ15012 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
LAPTM4AQ15012 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
LAPTM4AQ15012 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LAPTM4AQ15012 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LAPTM4AQ15012 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LAPTM4AQ15012 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LAPTM4AQ15012 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LAPTM4AQ15012 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LAPTM4AQ15012 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LAPTM4AQ15012 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LAPTM4AQ15012 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LAPTM4AQ15012 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LAPTM4AQ15012 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
LAPTM4AQ15012 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LAPTM4AQ15012 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LAPTM4AQ15012 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LAPTM4AQ15012 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LAPTM4AQ15012 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LAPTM4AQ15012 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LAPTM4AQ15012 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LAPTM4AQ15012 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LAPTM4AQ15012 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LAPTM4AQ15012 RNU6-836P-201ENST00000362920 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LAPTM4AQ15012 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LAPTM4AQ15012 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LAPTM4AQ15012 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LAPTM4AQ15012 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LAPTM4AQ15012 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
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