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Protein–RNA interactions for Protein: Q14714
SSPN, Sarcospan, human
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RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
SSPN
Q14714
RNU6-1232P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.29
SSPN
Q14714
RNU6-175P-201
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107 nt
BASIC
0.76
□□□□□ -2.29
SSPN
Q14714
MIR4677-201
ENST00000584153
80 nt
BASIC
0.76
□□□□□ -2.29
SSPN
Q14714
MIR6755-201
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66 nt
BASIC
0.76
□□□□□ -2.29
SSPN
Q14714
TEX15-201
ENST00000256246
10110 nt
TSL 1 (best)
BASIC
0.75
□□□□□ -2.29
SSPN
Q14714
MIR598-201
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97 nt
BASIC
0.75
□□□□□ -2.29
SSPN
Q14714
MIR501-201
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BASIC
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□□□□□ -2.29
SSPN
Q14714
SNORD71-201
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BASIC
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□□□□□ -2.29
SSPN
Q14714
RNU6-351P-201
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SSPN
Q14714
MIR548AD-201
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□□□□□ -2.29
SSPN
Q14714
ZBTB41-201
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BASIC
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□□□□□ -2.29
SSPN
Q14714
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SSPN
Q14714
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□□□□□ -2.29
SSPN
Q14714
RNU6-110P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.29
SSPN
Q14714
CCDC7-215
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4158 nt
APPRIS ALT2
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SSPN
Q14714
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BASIC
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□□□□□ -2.29
SSPN
Q14714
MIRLET7B-201
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Q14714
MIR527-201
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SSPN
Q14714
RNU4-54P-201
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□□□□□ -2.29
SSPN
Q14714
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BASIC
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□□□□□ -2.29
SSPN
Q14714
AL590095.2-201
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117 nt
BASIC
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□□□□□ -2.29
SSPN
Q14714
MIR6835-201
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BASIC
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□□□□□ -2.29
SSPN
Q14714
MIR6866-201
ENST00000638146
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□□□□□ -2.29
SSPN
Q14714
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□□□□□ -2.29
SSPN
Q14714
MIR548AG1-201
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66 nt
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SSPN
Q14714
RNU6-502P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.3
SSPN
Q14714
LINC01984-201
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TSL 3
BASIC
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□□□□□ -2.3
SSPN
Q14714
PVT1_3.1-201
ENST00000620853
95 nt
BASIC
0.71
□□□□□ -2.3
SSPN
Q14714
C9orf84-203
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4721 nt
APPRIS P3
TSL 5
BASIC
0.71
□□□□□ -2.3
SSPN
Q14714
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111 nt
BASIC
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□□□□□ -2.3
SSPN
Q14714
RNU6ATAC29P-201
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□□□□□ -2.3
SSPN
Q14714
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BASIC
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SSPN
Q14714
MIR4714-201
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SSPN
Q14714
MIR7110-201
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SSPN
Q14714
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SSPN
Q14714
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Q14714
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BASIC
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SSPN
Q14714
MIR876-201
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SSPN
Q14714
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BASIC
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□□□□□ -2.3
SSPN
Q14714
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SSPN
Q14714
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SSPN
Q14714
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□□□□□ -2.3
SSPN
Q14714
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Q14714
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SSPN
Q14714
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SSPN
Q14714
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SSPN
Q14714
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SSPN
Q14714
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SSPN
Q14714
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Q14714
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SSPN
Q14714
MIR3925-201
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SSPN
Q14714
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SSPN
Q14714
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□□□□□ -2.3
SSPN
Q14714
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BASIC
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□□□□□ -2.3
SSPN
Q14714
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BASIC
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□□□□□ -2.3
SSPN
Q14714
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BASIC
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SSPN
Q14714
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□□□□□ -2.31
SSPN
Q14714
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SSPN
Q14714
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SSPN
Q14714
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BASIC
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SSPN
Q14714
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BASIC
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SSPN
Q14714
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SSPN
Q14714
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BASIC
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SSPN
Q14714
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SSPN
Q14714
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BASIC
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SSPN
Q14714
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SSPN
Q14714
TRGJP-201
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APPRIS P1
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SSPN
Q14714
U6.58-201
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SSPN
Q14714
SNORD44.1-201
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BASIC
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□□□□□ -2.31
SSPN
Q14714
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BASIC
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□□□□□ -2.31
SSPN
Q14714
SPRY4-IT1_2.1-201
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BASIC
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□□□□□ -2.31
SSPN
Q14714
CALCRL-202
ENST00000409998
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APPRIS P1
TSL 5
BASIC
0.62
□□□□□ -2.31
SSPN
Q14714
AL353803.5-201
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141 nt
BASIC
0.61
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SSPN
Q14714
MIR499B-201
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□□□□□ -2.31
SSPN
Q14714
RNU6-810P-201
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BASIC
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SSPN
Q14714
RNU4-33P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.31
SSPN
Q14714
RNU6-945P-201
ENST00000383947
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BASIC
0.6
□□□□□ -2.31
SSPN
Q14714
MIR548X-201
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75 nt
BASIC
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□□□□□ -2.31
SSPN
Q14714
RN7SL793P-201
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296 nt
BASIC
0.6
□□□□□ -2.31
SSPN
Q14714
RNA5SP347-201
ENST00000362445
119 nt
BASIC
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□□□□□ -2.31
SSPN
Q14714
MIR216A-201
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110 nt
BASIC
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□□□□□ -2.31
SSPN
Q14714
MIR936-201
ENST00000401264
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BASIC
0.59
□□□□□ -2.31
SSPN
Q14714
SCARNA11.2-201
ENST00000517183
154 nt
BASIC
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□□□□□ -2.31
SSPN
Q14714
RNU7-129P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.32
SSPN
Q14714
AP000676.1-201
ENST00000533307
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BASIC
0.57
□□□□□ -2.32
SSPN
Q14714
RNU6-35P-201
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BASIC
0.56
□□□□□ -2.32
SSPN
Q14714
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ENST00000506562
193 nt
TSL 3
BASIC
0.56
□□□□□ -2.32
SSPN
Q14714
MIR4490-201
ENST00000582647
84 nt
BASIC
0.56
□□□□□ -2.32
SSPN
Q14714
RNU6-598P-201
ENST00000364017
105 nt
BASIC
0.55
□□□□□ -2.32
SSPN
Q14714
LINC00345-201
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285 nt
TSL 5
BASIC
0.55
□□□□□ -2.32
SSPN
Q14714
RNA5SP98-201
ENST00000363158
137 nt
BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
SSPN
Q14714
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BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
SSPN
Q14714
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BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
SSPN
Q14714
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BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
SSPN
Q14714
uc_338.17-201
ENST00000619633
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BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
SSPN
Q14714
RNU7-160P-201
ENST00000516660
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BASIC
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□□□□□ -2.32
SSPN
Q14714
MIR4432-201
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BASIC
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□□□□□ -2.32
SSPN
Q14714
AC108676.2-201
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0.53
□□□□□ -2.32
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Q14714
MIR103A1-201
ENST00000362165
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BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
SSPN
Q14714
RNU6-127P-201
ENST00000390897
107 nt
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
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