Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HDAC1Q13547 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HDAC1Q13547 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HDAC1Q13547 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HDAC1Q13547 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HDAC1Q13547 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HDAC1Q13547 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HDAC1Q13547 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HDAC1Q13547 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HDAC1Q13547 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HDAC1Q13547 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HDAC1Q13547 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HDAC1Q13547 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HDAC1Q13547 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HDAC1Q13547 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HDAC1Q13547 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HDAC1Q13547 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HDAC1Q13547 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HDAC1Q13547 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HDAC1Q13547 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HDAC1Q13547 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HDAC1Q13547 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HDAC1Q13547 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HDAC1Q13547 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HDAC1Q13547 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HDAC1Q13547 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HDAC1Q13547 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HDAC1Q13547 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HDAC1Q13547 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HDAC1Q13547 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HDAC1Q13547 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HDAC1Q13547 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
HDAC1Q13547 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HDAC1Q13547 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HDAC1Q13547 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HDAC1Q13547 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HDAC1Q13547 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HDAC1Q13547 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HDAC1Q13547 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
HDAC1Q13547 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
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HDAC1Q13547 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HDAC1Q13547 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
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HDAC1Q13547 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
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HDAC1Q13547 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
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HDAC1Q13547 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HDAC1Q13547 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HDAC1Q13547 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HDAC1Q13547 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
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HDAC1Q13547 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
HDAC1Q13547 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
HDAC1Q13547 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
HDAC1Q13547 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
HDAC1Q13547 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
HDAC1Q13547 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HDAC1Q13547 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
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HDAC1Q13547 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
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HDAC1Q13547 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HDAC1Q13547 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HDAC1Q13547 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HDAC1Q13547 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HDAC1Q13547 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HDAC1Q13547 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HDAC1Q13547 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HDAC1Q13547 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HDAC1Q13547 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
HDAC1Q13547 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
HDAC1Q13547 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
HDAC1Q13547 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
HDAC1Q13547 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
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