Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SQSTM1Q13501 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SQSTM1Q13501 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SQSTM1Q13501 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SQSTM1Q13501 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SQSTM1Q13501 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SQSTM1Q13501 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SQSTM1Q13501 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SQSTM1Q13501 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SQSTM1Q13501 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SQSTM1Q13501 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SQSTM1Q13501 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SQSTM1Q13501 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SQSTM1Q13501 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SQSTM1Q13501 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
SQSTM1Q13501 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SQSTM1Q13501 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SQSTM1Q13501 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SQSTM1Q13501 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SQSTM1Q13501 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SQSTM1Q13501 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SQSTM1Q13501 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SQSTM1Q13501 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SQSTM1Q13501 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SQSTM1Q13501 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SQSTM1Q13501 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SQSTM1Q13501 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SQSTM1Q13501 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SQSTM1Q13501 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SQSTM1Q13501 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SQSTM1Q13501 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SQSTM1Q13501 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SQSTM1Q13501 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SQSTM1Q13501 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SQSTM1Q13501 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SQSTM1Q13501 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SQSTM1Q13501 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SQSTM1Q13501 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SQSTM1Q13501 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SQSTM1Q13501 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SQSTM1Q13501 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SQSTM1Q13501 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SQSTM1Q13501 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SQSTM1Q13501 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SQSTM1Q13501 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SQSTM1Q13501 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SQSTM1Q13501 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SQSTM1Q13501 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SQSTM1Q13501 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SQSTM1Q13501 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SQSTM1Q13501 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SQSTM1Q13501 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SQSTM1Q13501 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SQSTM1Q13501 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SQSTM1Q13501 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SQSTM1Q13501 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
SQSTM1Q13501 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SQSTM1Q13501 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SQSTM1Q13501 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SQSTM1Q13501 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SQSTM1Q13501 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SQSTM1Q13501 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SQSTM1Q13501 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
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SQSTM1Q13501 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SQSTM1Q13501 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SQSTM1Q13501 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SQSTM1Q13501 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SQSTM1Q13501 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SQSTM1Q13501 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SQSTM1Q13501 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
SQSTM1Q13501 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SQSTM1Q13501 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SQSTM1Q13501 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SQSTM1Q13501 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
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SQSTM1Q13501 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SQSTM1Q13501 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SQSTM1Q13501 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SQSTM1Q13501 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
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SQSTM1Q13501 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SQSTM1Q13501 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SQSTM1Q13501 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SQSTM1Q13501 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SQSTM1Q13501 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SQSTM1Q13501 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SQSTM1Q13501 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
SQSTM1Q13501 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SQSTM1Q13501 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SQSTM1Q13501 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SQSTM1Q13501 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SQSTM1Q13501 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SQSTM1Q13501 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SQSTM1Q13501 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SQSTM1Q13501 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SQSTM1Q13501 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SQSTM1Q13501 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SQSTM1Q13501 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SQSTM1Q13501 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
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