Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SF3B2Q13435 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SF3B2Q13435 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SF3B2Q13435 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SF3B2Q13435 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
SF3B2Q13435 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SF3B2Q13435 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SF3B2Q13435 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SF3B2Q13435 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SF3B2Q13435 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SF3B2Q13435 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SF3B2Q13435 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SF3B2Q13435 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SF3B2Q13435 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SF3B2Q13435 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SF3B2Q13435 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SF3B2Q13435 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SF3B2Q13435 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SF3B2Q13435 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SF3B2Q13435 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SF3B2Q13435 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SF3B2Q13435 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SF3B2Q13435 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SF3B2Q13435 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SF3B2Q13435 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SF3B2Q13435 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SF3B2Q13435 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SF3B2Q13435 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SF3B2Q13435 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SF3B2Q13435 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SF3B2Q13435 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SF3B2Q13435 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SF3B2Q13435 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SF3B2Q13435 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SF3B2Q13435 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SF3B2Q13435 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SF3B2Q13435 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SF3B2Q13435 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SF3B2Q13435 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SF3B2Q13435 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SF3B2Q13435 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SF3B2Q13435 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SF3B2Q13435 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SF3B2Q13435 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SF3B2Q13435 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SF3B2Q13435 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SF3B2Q13435 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SF3B2Q13435 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SF3B2Q13435 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SF3B2Q13435 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SF3B2Q13435 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SF3B2Q13435 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SF3B2Q13435 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SF3B2Q13435 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SF3B2Q13435 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SF3B2Q13435 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SF3B2Q13435 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SF3B2Q13435 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SF3B2Q13435 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SF3B2Q13435 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SF3B2Q13435 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SF3B2Q13435 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SF3B2Q13435 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SF3B2Q13435 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SF3B2Q13435 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SF3B2Q13435 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SF3B2Q13435 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SF3B2Q13435 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SF3B2Q13435 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SF3B2Q13435 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SF3B2Q13435 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SF3B2Q13435 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SF3B2Q13435 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SF3B2Q13435 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SF3B2Q13435 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SF3B2Q13435 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SF3B2Q13435 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SF3B2Q13435 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SF3B2Q13435 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SF3B2Q13435 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SF3B2Q13435 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SF3B2Q13435 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SF3B2Q13435 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SF3B2Q13435 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SF3B2Q13435 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SF3B2Q13435 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SF3B2Q13435 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SF3B2Q13435 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SF3B2Q13435 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SF3B2Q13435 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SF3B2Q13435 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SF3B2Q13435 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
SF3B2Q13435 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SF3B2Q13435 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SF3B2Q13435 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SF3B2Q13435 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SF3B2Q13435 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SF3B2Q13435 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SF3B2Q13435 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SF3B2Q13435 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 373.1 ms