Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
TCOF1Q13428 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
TCOF1Q13428 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
TCOF1Q13428 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
TCOF1Q13428 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
TCOF1Q13428 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
TCOF1Q13428 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
TCOF1Q13428 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
TCOF1Q13428 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
TCOF1Q13428 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
TCOF1Q13428 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
TCOF1Q13428 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
TCOF1Q13428 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
TCOF1Q13428 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
TCOF1Q13428 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
TCOF1Q13428 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
TCOF1Q13428 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
TCOF1Q13428 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
TCOF1Q13428 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
TCOF1Q13428 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
TCOF1Q13428 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
TCOF1Q13428 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
TCOF1Q13428 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
TCOF1Q13428 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
TCOF1Q13428 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
TCOF1Q13428 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
TCOF1Q13428 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.91
TCOF1Q13428 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.91
TCOF1Q13428 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
TCOF1Q13428 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
TCOF1Q13428 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
TCOF1Q13428 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
TCOF1Q13428 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
TCOF1Q13428 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
TCOF1Q13428 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
TCOF1Q13428 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
TCOF1Q13428 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
TCOF1Q13428 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
TCOF1Q13428 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
TCOF1Q13428 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
TCOF1Q13428 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
TCOF1Q13428 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
TCOF1Q13428 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
TCOF1Q13428 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
TCOF1Q13428 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
TCOF1Q13428 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.93
TCOF1Q13428 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.93
TCOF1Q13428 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.93
TCOF1Q13428 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
TCOF1Q13428 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
TCOF1Q13428 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
TCOF1Q13428 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
TCOF1Q13428 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
TCOF1Q13428 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
TCOF1Q13428 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
TCOF1Q13428 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
TCOF1Q13428 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
TCOF1Q13428 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
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TCOF1Q13428 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
TCOF1Q13428 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
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TCOF1Q13428 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
TCOF1Q13428 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
TCOF1Q13428 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
TCOF1Q13428 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
TCOF1Q13428 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
TCOF1Q13428 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
TCOF1Q13428 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.94
TCOF1Q13428 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.94
TCOF1Q13428 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.94
TCOF1Q13428 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
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TCOF1Q13428 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
TCOF1Q13428 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
TCOF1Q13428 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
TCOF1Q13428 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
TCOF1Q13428 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
TCOF1Q13428 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
TCOF1Q13428 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
TCOF1Q13428 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
TCOF1Q13428 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
TCOF1Q13428 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
TCOF1Q13428 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
TCOF1Q13428 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
TCOF1Q13428 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
TCOF1Q13428 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
TCOF1Q13428 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
TCOF1Q13428 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
TCOF1Q13428 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
TCOF1Q13428 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
TCOF1Q13428 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
TCOF1Q13428 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
TCOF1Q13428 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.94
TCOF1Q13428 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.94
TCOF1Q13428 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
TCOF1Q13428 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
TCOF1Q13428 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
TCOF1Q13428 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
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