Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SP140Q13342 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SP140Q13342 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SP140Q13342 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SP140Q13342 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SP140Q13342 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SP140Q13342 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SP140Q13342 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SP140Q13342 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SP140Q13342 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SP140Q13342 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SP140Q13342 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SP140Q13342 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SP140Q13342 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SP140Q13342 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SP140Q13342 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SP140Q13342 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SP140Q13342 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SP140Q13342 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SP140Q13342 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SP140Q13342 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SP140Q13342 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SP140Q13342 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SP140Q13342 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SP140Q13342 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SP140Q13342 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SP140Q13342 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SP140Q13342 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SP140Q13342 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SP140Q13342 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SP140Q13342 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SP140Q13342 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SP140Q13342 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SP140Q13342 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SP140Q13342 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SP140Q13342 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SP140Q13342 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SP140Q13342 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SP140Q13342 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SP140Q13342 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SP140Q13342 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
SP140Q13342 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SP140Q13342 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SP140Q13342 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SP140Q13342 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SP140Q13342 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SP140Q13342 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SP140Q13342 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SP140Q13342 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SP140Q13342 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SP140Q13342 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SP140Q13342 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SP140Q13342 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SP140Q13342 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SP140Q13342 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
SP140Q13342 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SP140Q13342 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
SP140Q13342 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SP140Q13342 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SP140Q13342 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SP140Q13342 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SP140Q13342 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SP140Q13342 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SP140Q13342 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SP140Q13342 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SP140Q13342 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SP140Q13342 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SP140Q13342 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SP140Q13342 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SP140Q13342 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SP140Q13342 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SP140Q13342 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SP140Q13342 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SP140Q13342 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SP140Q13342 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SP140Q13342 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SP140Q13342 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SP140Q13342 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SP140Q13342 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SP140Q13342 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SP140Q13342 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SP140Q13342 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SP140Q13342 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SP140Q13342 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SP140Q13342 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SP140Q13342 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SP140Q13342 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SP140Q13342 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SP140Q13342 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SP140Q13342 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SP140Q13342 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SP140Q13342 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SP140Q13342 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SP140Q13342 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SP140Q13342 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SP140Q13342 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SP140Q13342 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SP140Q13342 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SP140Q13342 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SP140Q13342 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms