Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CLN3Q13286 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CLN3Q13286 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CLN3Q13286 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CLN3Q13286 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CLN3Q13286 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CLN3Q13286 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CLN3Q13286 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CLN3Q13286 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CLN3Q13286 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.94□□□□□ -2.26
CLN3Q13286 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CLN3Q13286 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CLN3Q13286 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CLN3Q13286 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CLN3Q13286 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CLN3Q13286 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CLN3Q13286 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CLN3Q13286 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
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CLN3Q13286 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CLN3Q13286 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CLN3Q13286 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CLN3Q13286 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CLN3Q13286 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CLN3Q13286 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CLN3Q13286 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CLN3Q13286 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CLN3Q13286 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CLN3Q13286 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CLN3Q13286 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CLN3Q13286 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CLN3Q13286 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CLN3Q13286 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CLN3Q13286 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CLN3Q13286 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CLN3Q13286 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CLN3Q13286 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CLN3Q13286 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CLN3Q13286 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
CLN3Q13286 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CLN3Q13286 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CLN3Q13286 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CLN3Q13286 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CLN3Q13286 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CLN3Q13286 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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CLN3Q13286 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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CLN3Q13286 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CLN3Q13286 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CLN3Q13286 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
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CLN3Q13286 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CLN3Q13286 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
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CLN3Q13286 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
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CLN3Q13286 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
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CLN3Q13286 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
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CLN3Q13286 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
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CLN3Q13286 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CLN3Q13286 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CLN3Q13286 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CLN3Q13286 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CLN3Q13286 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
CLN3Q13286 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CLN3Q13286 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CLN3Q13286 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CLN3Q13286 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CLN3Q13286 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
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CLN3Q13286 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CLN3Q13286 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.69□□□□□ -2.3
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