Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CHAF1BQ13112 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CHAF1BQ13112 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CHAF1BQ13112 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CHAF1BQ13112 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CHAF1BQ13112 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CHAF1BQ13112 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CHAF1BQ13112 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CHAF1BQ13112 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CHAF1BQ13112 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CHAF1BQ13112 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CHAF1BQ13112 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CHAF1BQ13112 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CHAF1BQ13112 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CHAF1BQ13112 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CHAF1BQ13112 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CHAF1BQ13112 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CHAF1BQ13112 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
CHAF1BQ13112 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
CHAF1BQ13112 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
CHAF1BQ13112 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
CHAF1BQ13112 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
CHAF1BQ13112 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
CHAF1BQ13112 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
CHAF1BQ13112 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
CHAF1BQ13112 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-1.11□□□□□ -2.59
CHAF1BQ13112 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
CHAF1BQ13112 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
CHAF1BQ13112 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
CHAF1BQ13112 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
CHAF1BQ13112 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
CHAF1BQ13112 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
CHAF1BQ13112 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
CHAF1BQ13112 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
CHAF1BQ13112 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
CHAF1BQ13112 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
CHAF1BQ13112 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CHAF1BQ13112 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CHAF1BQ13112 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CHAF1BQ13112 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CHAF1BQ13112 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
CHAF1BQ13112 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
CHAF1BQ13112 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
CHAF1BQ13112 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
CHAF1BQ13112 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
CHAF1BQ13112 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
CHAF1BQ13112 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
CHAF1BQ13112 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CHAF1BQ13112 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CHAF1BQ13112 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CHAF1BQ13112 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CHAF1BQ13112 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CHAF1BQ13112 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CHAF1BQ13112 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
CHAF1BQ13112 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
CHAF1BQ13112 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
CHAF1BQ13112 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
CHAF1BQ13112 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
CHAF1BQ13112 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
CHAF1BQ13112 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CHAF1BQ13112 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CHAF1BQ13112 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CHAF1BQ13112 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CHAF1BQ13112 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CHAF1BQ13112 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CHAF1BQ13112 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CHAF1BQ13112 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CHAF1BQ13112 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CHAF1BQ13112 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CHAF1BQ13112 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CHAF1BQ13112 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CHAF1BQ13112 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CHAF1BQ13112 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CHAF1BQ13112 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CHAF1BQ13112 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CHAF1BQ13112 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CHAF1BQ13112 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CHAF1BQ13112 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CHAF1BQ13112 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CHAF1BQ13112 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CHAF1BQ13112 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CHAF1BQ13112 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.27□□□□□ -2.61
CHAF1BQ13112 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-1.28□□□□□ -2.61
CHAF1BQ13112 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CHAF1BQ13112 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CHAF1BQ13112 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CHAF1BQ13112 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CHAF1BQ13112 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CHAF1BQ13112 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CHAF1BQ13112 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CHAF1BQ13112 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CHAF1BQ13112 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CHAF1BQ13112 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CHAF1BQ13112 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CHAF1BQ13112 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CHAF1BQ13112 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CHAF1BQ13112 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CHAF1BQ13112 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CHAF1BQ13112 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CHAF1BQ13112 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
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