Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CHAF1AQ13111 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CHAF1AQ13111 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CHAF1AQ13111 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CHAF1AQ13111 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CHAF1AQ13111 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CHAF1AQ13111 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CHAF1AQ13111 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CHAF1AQ13111 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CHAF1AQ13111 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CHAF1AQ13111 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
CHAF1AQ13111 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CHAF1AQ13111 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CHAF1AQ13111 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CHAF1AQ13111 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CHAF1AQ13111 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CHAF1AQ13111 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CHAF1AQ13111 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CHAF1AQ13111 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CHAF1AQ13111 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
CHAF1AQ13111 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CHAF1AQ13111 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CHAF1AQ13111 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CHAF1AQ13111 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CHAF1AQ13111 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CHAF1AQ13111 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CHAF1AQ13111 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CHAF1AQ13111 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CHAF1AQ13111 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CHAF1AQ13111 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CHAF1AQ13111 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CHAF1AQ13111 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CHAF1AQ13111 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CHAF1AQ13111 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CHAF1AQ13111 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CHAF1AQ13111 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CHAF1AQ13111 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CHAF1AQ13111 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CHAF1AQ13111 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CHAF1AQ13111 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CHAF1AQ13111 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CHAF1AQ13111 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CHAF1AQ13111 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CHAF1AQ13111 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CHAF1AQ13111 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CHAF1AQ13111 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CHAF1AQ13111 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CHAF1AQ13111 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CHAF1AQ13111 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CHAF1AQ13111 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CHAF1AQ13111 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CHAF1AQ13111 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CHAF1AQ13111 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CHAF1AQ13111 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CHAF1AQ13111 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CHAF1AQ13111 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CHAF1AQ13111 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CHAF1AQ13111 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CHAF1AQ13111 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CHAF1AQ13111 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CHAF1AQ13111 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CHAF1AQ13111 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CHAF1AQ13111 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CHAF1AQ13111 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CHAF1AQ13111 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CHAF1AQ13111 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CHAF1AQ13111 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CHAF1AQ13111 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
CHAF1AQ13111 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CHAF1AQ13111 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CHAF1AQ13111 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CHAF1AQ13111 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CHAF1AQ13111 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CHAF1AQ13111 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CHAF1AQ13111 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CHAF1AQ13111 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CHAF1AQ13111 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CHAF1AQ13111 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CHAF1AQ13111 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CHAF1AQ13111 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CHAF1AQ13111 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CHAF1AQ13111 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CHAF1AQ13111 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CHAF1AQ13111 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
CHAF1AQ13111 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CHAF1AQ13111 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CHAF1AQ13111 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
CHAF1AQ13111 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CHAF1AQ13111 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CHAF1AQ13111 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CHAF1AQ13111 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CHAF1AQ13111 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CHAF1AQ13111 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CHAF1AQ13111 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CHAF1AQ13111 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CHAF1AQ13111 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CHAF1AQ13111 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CHAF1AQ13111 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CHAF1AQ13111 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CHAF1AQ13111 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184.5 ms