Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
E2F1Q01094 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
E2F1Q01094 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
E2F1Q01094 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
E2F1Q01094 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
E2F1Q01094 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
E2F1Q01094 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
E2F1Q01094 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
E2F1Q01094 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
E2F1Q01094 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
E2F1Q01094 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
E2F1Q01094 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
E2F1Q01094 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
E2F1Q01094 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
E2F1Q01094 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
E2F1Q01094 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
E2F1Q01094 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
E2F1Q01094 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
E2F1Q01094 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
E2F1Q01094 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
E2F1Q01094 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
E2F1Q01094 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
E2F1Q01094 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
E2F1Q01094 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
E2F1Q01094 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
E2F1Q01094 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
E2F1Q01094 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
E2F1Q01094 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
E2F1Q01094 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
E2F1Q01094 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
E2F1Q01094 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
E2F1Q01094 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
E2F1Q01094 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
E2F1Q01094 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
E2F1Q01094 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
E2F1Q01094 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
E2F1Q01094 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
E2F1Q01094 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
E2F1Q01094 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
E2F1Q01094 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
E2F1Q01094 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
E2F1Q01094 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
E2F1Q01094 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
E2F1Q01094 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
E2F1Q01094 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
E2F1Q01094 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
E2F1Q01094 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
E2F1Q01094 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
E2F1Q01094 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
E2F1Q01094 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
E2F1Q01094 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
E2F1Q01094 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
E2F1Q01094 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
E2F1Q01094 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
E2F1Q01094 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
E2F1Q01094 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
E2F1Q01094 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
E2F1Q01094 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
E2F1Q01094 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
E2F1Q01094 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
E2F1Q01094 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
E2F1Q01094 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
E2F1Q01094 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
E2F1Q01094 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
E2F1Q01094 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
E2F1Q01094 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
E2F1Q01094 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
E2F1Q01094 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
E2F1Q01094 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
E2F1Q01094 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
E2F1Q01094 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
E2F1Q01094 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
E2F1Q01094 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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E2F1Q01094 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
E2F1Q01094 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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E2F1Q01094 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
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E2F1Q01094 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
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E2F1Q01094 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
E2F1Q01094 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
E2F1Q01094 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
E2F1Q01094 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
E2F1Q01094 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
E2F1Q01094 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
E2F1Q01094 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
E2F1Q01094 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.3□□□□□ -2.36
E2F1Q01094 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
E2F1Q01094 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
E2F1Q01094 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
E2F1Q01094 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
E2F1Q01094 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
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