Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD11P31277 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD11P31277 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD11P31277 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD11P31277 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD11P31277 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD11P31277 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD11P31277 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD11P31277 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXD11P31277 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXD11P31277 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXD11P31277 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXD11P31277 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXD11P31277 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD11P31277 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD11P31277 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD11P31277 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD11P31277 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD11P31277 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD11P31277 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD11P31277 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD11P31277 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD11P31277 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD11P31277 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD11P31277 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD11P31277 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD11P31277 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD11P31277 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD11P31277 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD11P31277 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD11P31277 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD11P31277 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD11P31277 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD11P31277 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD11P31277 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HOXD11P31277 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HOXD11P31277 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HOXD11P31277 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD11P31277 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD11P31277 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HOXD11P31277 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HOXD11P31277 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HOXD11P31277 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HOXD11P31277 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HOXD11P31277 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HOXD11P31277 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD11P31277 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD11P31277 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD11P31277 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HOXD11P31277 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HOXD11P31277 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HOXD11P31277 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD11P31277 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD11P31277 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD11P31277 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HOXD11P31277 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HOXD11P31277 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HOXD11P31277 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HOXD11P31277 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HOXD11P31277 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HOXD11P31277 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HOXD11P31277 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HOXD11P31277 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HOXD11P31277 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HOXD11P31277 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD11P31277 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD11P31277 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD11P31277 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD11P31277 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD11P31277 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD11P31277 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD11P31277 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD11P31277 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXD11P31277 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXD11P31277 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HOXD11P31277 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HOXD11P31277 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXD11P31277 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXD11P31277 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD11P31277 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD11P31277 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD11P31277 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD11P31277 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD11P31277 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD11P31277 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD11P31277 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HOXD11P31277 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HOXD11P31277 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HOXD11P31277 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HOXD11P31277 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HOXD11P31277 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HOXD11P31277 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HOXD11P31277 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HOXD11P31277 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HOXD11P31277 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
HOXD11P31277 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HOXD11P31277 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HOXD11P31277 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXD11P31277 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXD11P31277 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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