Protein–RNA interactions for Protein: P20393

NR1D1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D1P20393 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NR1D1P20393 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NR1D1P20393 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NR1D1P20393 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NR1D1P20393 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NR1D1P20393 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NR1D1P20393 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NR1D1P20393 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NR1D1P20393 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NR1D1P20393 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NR1D1P20393 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NR1D1P20393 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NR1D1P20393 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NR1D1P20393 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NR1D1P20393 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NR1D1P20393 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NR1D1P20393 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
NR1D1P20393 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NR1D1P20393 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NR1D1P20393 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NR1D1P20393 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NR1D1P20393 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NR1D1P20393 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NR1D1P20393 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NR1D1P20393 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NR1D1P20393 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NR1D1P20393 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NR1D1P20393 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NR1D1P20393 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NR1D1P20393 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NR1D1P20393 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NR1D1P20393 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NR1D1P20393 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NR1D1P20393 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NR1D1P20393 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NR1D1P20393 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NR1D1P20393 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NR1D1P20393 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NR1D1P20393 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NR1D1P20393 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NR1D1P20393 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NR1D1P20393 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NR1D1P20393 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NR1D1P20393 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NR1D1P20393 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NR1D1P20393 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NR1D1P20393 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NR1D1P20393 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NR1D1P20393 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NR1D1P20393 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
NR1D1P20393 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.02□□□□□ -2.41
NR1D1P20393 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
NR1D1P20393 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
NR1D1P20393 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
NR1D1P20393 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
NR1D1P20393 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
NR1D1P20393 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
NR1D1P20393 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC0□□□□□ -2.41
NR1D1P20393 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC0□□□□□ -2.41
NR1D1P20393 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC0□□□□□ -2.41
NR1D1P20393 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC0□□□□□ -2.41
NR1D1P20393 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC0□□□□□ -2.41
NR1D1P20393 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC0□□□□□ -2.41
NR1D1P20393 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC0□□□□□ -2.41
NR1D1P20393 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC0□□□□□ -2.41
NR1D1P20393 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NR1D1P20393 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NR1D1P20393 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
NR1D1P20393 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
NR1D1P20393 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
NR1D1P20393 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
NR1D1P20393 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
NR1D1P20393 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
NR1D1P20393 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
NR1D1P20393 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
NR1D1P20393 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
NR1D1P20393 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
NR1D1P20393 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
NR1D1P20393 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
NR1D1P20393 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
NR1D1P20393 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
NR1D1P20393 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
NR1D1P20393 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
NR1D1P20393 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
NR1D1P20393 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
NR1D1P20393 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
NR1D1P20393 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
NR1D1P20393 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
NR1D1P20393 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
NR1D1P20393 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
NR1D1P20393 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
NR1D1P20393 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
NR1D1P20393 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
NR1D1P20393 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
NR1D1P20393 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
NR1D1P20393 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
NR1D1P20393 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
NR1D1P20393 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
NR1D1P20393 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
NR1D1P20393 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 295.3 ms