Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

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Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
VAMP4O75379 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
VAMP4O75379 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
VAMP4O75379 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
VAMP4O75379 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
VAMP4O75379 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
VAMP4O75379 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
VAMP4O75379 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
VAMP4O75379 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
VAMP4O75379 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
VAMP4O75379 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
VAMP4O75379 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
VAMP4O75379 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
VAMP4O75379 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
VAMP4O75379 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
VAMP4O75379 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
VAMP4O75379 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
VAMP4O75379 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
VAMP4O75379 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
VAMP4O75379 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
VAMP4O75379 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
VAMP4O75379 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
VAMP4O75379 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
VAMP4O75379 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
VAMP4O75379 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
VAMP4O75379 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
VAMP4O75379 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
VAMP4O75379 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
VAMP4O75379 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
VAMP4O75379 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
VAMP4O75379 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
VAMP4O75379 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
VAMP4O75379 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
VAMP4O75379 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
VAMP4O75379 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
VAMP4O75379 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
VAMP4O75379 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
VAMP4O75379 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
VAMP4O75379 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
VAMP4O75379 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
VAMP4O75379 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
VAMP4O75379 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
VAMP4O75379 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
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VAMP4O75379 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
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VAMP4O75379 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
VAMP4O75379 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
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VAMP4O75379 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
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VAMP4O75379 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VAMP4O75379 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VAMP4O75379 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
VAMP4O75379 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VAMP4O75379 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VAMP4O75379 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VAMP4O75379 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VAMP4O75379 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VAMP4O75379 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VAMP4O75379 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
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