Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SOBPA7XYQ1 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SOBPA7XYQ1 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SOBPA7XYQ1 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SOBPA7XYQ1 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SOBPA7XYQ1 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SOBPA7XYQ1 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SOBPA7XYQ1 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SOBPA7XYQ1 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SOBPA7XYQ1 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SOBPA7XYQ1 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SOBPA7XYQ1 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SOBPA7XYQ1 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SOBPA7XYQ1 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
SOBPA7XYQ1 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SOBPA7XYQ1 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SOBPA7XYQ1 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
SOBPA7XYQ1 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SOBPA7XYQ1 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SOBPA7XYQ1 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SOBPA7XYQ1 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SOBPA7XYQ1 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SOBPA7XYQ1 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SOBPA7XYQ1 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SOBPA7XYQ1 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SOBPA7XYQ1 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SOBPA7XYQ1 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SOBPA7XYQ1 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SOBPA7XYQ1 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SOBPA7XYQ1 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SOBPA7XYQ1 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SOBPA7XYQ1 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SOBPA7XYQ1 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SOBPA7XYQ1 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SOBPA7XYQ1 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SOBPA7XYQ1 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SOBPA7XYQ1 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SOBPA7XYQ1 RNU6ATAC14P-201ENST00000516218 91 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SOBPA7XYQ1 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SOBPA7XYQ1 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SOBPA7XYQ1 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SOBPA7XYQ1 RNU6-724P-201ENST00000390958 105 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SOBPA7XYQ1 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SOBPA7XYQ1 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SOBPA7XYQ1 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SOBPA7XYQ1 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SOBPA7XYQ1 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SOBPA7XYQ1 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SOBPA7XYQ1 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SOBPA7XYQ1 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SOBPA7XYQ1 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SOBPA7XYQ1 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SOBPA7XYQ1 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SOBPA7XYQ1 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SOBPA7XYQ1 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SOBPA7XYQ1 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SOBPA7XYQ1 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SOBPA7XYQ1 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SOBPA7XYQ1 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SOBPA7XYQ1 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SOBPA7XYQ1 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SOBPA7XYQ1 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SOBPA7XYQ1 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SOBPA7XYQ1 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SOBPA7XYQ1 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SOBPA7XYQ1 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SOBPA7XYQ1 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SOBPA7XYQ1 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SOBPA7XYQ1 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SOBPA7XYQ1 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SOBPA7XYQ1 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SOBPA7XYQ1 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SOBPA7XYQ1 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SOBPA7XYQ1 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SOBPA7XYQ1 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SOBPA7XYQ1 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SOBPA7XYQ1 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SOBPA7XYQ1 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
SOBPA7XYQ1 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SOBPA7XYQ1 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SOBPA7XYQ1 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SOBPA7XYQ1 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SOBPA7XYQ1 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SOBPA7XYQ1 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SOBPA7XYQ1 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SOBPA7XYQ1 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SOBPA7XYQ1 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SOBPA7XYQ1 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SOBPA7XYQ1 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SOBPA7XYQ1 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SOBPA7XYQ1 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SOBPA7XYQ1 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SOBPA7XYQ1 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SOBPA7XYQ1 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SOBPA7XYQ1 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SOBPA7XYQ1 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SOBPA7XYQ1 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SOBPA7XYQ1 U6.103-201ENST00000637085 61 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
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