Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms