Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms