Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms