Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z266

Snapin, SNARE-associated protein Snapin, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnapinQ9Z266 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SnapinQ9Z266 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SnapinQ9Z266 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SnapinQ9Z266 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SnapinQ9Z266 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SnapinQ9Z266 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SnapinQ9Z266 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SnapinQ9Z266 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SnapinQ9Z266 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SnapinQ9Z266 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SnapinQ9Z266 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SnapinQ9Z266 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SnapinQ9Z266 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SnapinQ9Z266 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SnapinQ9Z266 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SnapinQ9Z266 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SnapinQ9Z266 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SnapinQ9Z266 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SnapinQ9Z266 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SnapinQ9Z266 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SnapinQ9Z266 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SnapinQ9Z266 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SnapinQ9Z266 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SnapinQ9Z266 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SnapinQ9Z266 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SnapinQ9Z266 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SnapinQ9Z266 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SnapinQ9Z266 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SnapinQ9Z266 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SnapinQ9Z266 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SnapinQ9Z266 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SnapinQ9Z266 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SnapinQ9Z266 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SnapinQ9Z266 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SnapinQ9Z266 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SnapinQ9Z266 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SnapinQ9Z266 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SnapinQ9Z266 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SnapinQ9Z266 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SnapinQ9Z266 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SnapinQ9Z266 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SnapinQ9Z266 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SnapinQ9Z266 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SnapinQ9Z266 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SnapinQ9Z266 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SnapinQ9Z266 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SnapinQ9Z266 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SnapinQ9Z266 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SnapinQ9Z266 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SnapinQ9Z266 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SnapinQ9Z266 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SnapinQ9Z266 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SnapinQ9Z266 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SnapinQ9Z266 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SnapinQ9Z266 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms