Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn6Q9Z262 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn6Q9Z262 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn6Q9Z262 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn6Q9Z262 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn6Q9Z262 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn6Q9Z262 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn6Q9Z262 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn6Q9Z262 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn6Q9Z262 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn6Q9Z262 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn6Q9Z262 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn6Q9Z262 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn6Q9Z262 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn6Q9Z262 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Cldn6Q9Z262 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn6Q9Z262 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn6Q9Z262 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn6Q9Z262 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn6Q9Z262 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Cldn6Q9Z262 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn6Q9Z262 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn6Q9Z262 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn6Q9Z262 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn6Q9Z262 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn6Q9Z262 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn6Q9Z262 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn6Q9Z262 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn6Q9Z262 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cldn6Q9Z262 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cldn6Q9Z262 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn6Q9Z262 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn6Q9Z262 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cldn6Q9Z262 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn6Q9Z262 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn6Q9Z262 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cldn6Q9Z262 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn6Q9Z262 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn6Q9Z262 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn6Q9Z262 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn6Q9Z262 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn6Q9Z262 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn6Q9Z262 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn6Q9Z262 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Cldn6Q9Z262 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Cldn6Q9Z262 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn6Q9Z262 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn6Q9Z262 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn6Q9Z262 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Cldn6Q9Z262 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Cldn6Q9Z262 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn6Q9Z262 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Cldn6Q9Z262 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn6Q9Z262 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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