Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms