Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap4s1Q9WVL1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap4s1Q9WVL1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap4s1Q9WVL1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap4s1Q9WVL1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap4s1Q9WVL1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap4s1Q9WVL1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap4s1Q9WVL1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap4s1Q9WVL1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap4s1Q9WVL1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap4s1Q9WVL1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap4s1Q9WVL1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap4s1Q9WVL1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap4s1Q9WVL1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap4s1Q9WVL1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap4s1Q9WVL1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap4s1Q9WVL1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap4s1Q9WVL1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap4s1Q9WVL1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap4s1Q9WVL1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap4s1Q9WVL1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap4s1Q9WVL1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap4s1Q9WVL1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap4s1Q9WVL1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap4s1Q9WVL1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap4s1Q9WVL1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap4s1Q9WVL1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap4s1Q9WVL1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap4s1Q9WVL1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap4s1Q9WVL1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap4s1Q9WVL1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap4s1Q9WVL1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap4s1Q9WVL1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms