Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pfdn5Q9WU28 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pfdn5Q9WU28 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pfdn5Q9WU28 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pfdn5Q9WU28 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pfdn5Q9WU28 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pfdn5Q9WU28 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pfdn5Q9WU28 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pfdn5Q9WU28 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pfdn5Q9WU28 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pfdn5Q9WU28 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pfdn5Q9WU28 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pfdn5Q9WU28 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pfdn5Q9WU28 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pfdn5Q9WU28 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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