Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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