Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Csnk1a1-208ENSMUST00000167187 1222 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lhx6Q9R1R0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lhx6Q9R1R0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lhx6Q9R1R0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lhx6Q9R1R0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lhx6Q9R1R0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lhx6Q9R1R0 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Lhx6Q9R1R0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lhx6Q9R1R0 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Lhx6Q9R1R0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Lhx6Q9R1R0 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lhx6Q9R1R0 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lhx6Q9R1R0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lhx6Q9R1R0 Vmn1r192-201ENSMUST00000072632 1067 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Lhx6Q9R1R0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lhx6Q9R1R0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lhx6Q9R1R0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lhx6Q9R1R0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lhx6Q9R1R0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lhx6Q9R1R0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lhx6Q9R1R0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lhx6Q9R1R0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lhx6Q9R1R0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lhx6Q9R1R0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lhx6Q9R1R0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lhx6Q9R1R0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lhx6Q9R1R0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx6Q9R1R0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx6Q9R1R0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx6Q9R1R0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx6Q9R1R0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx6Q9R1R0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx6Q9R1R0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx6Q9R1R0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx6Q9R1R0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx6Q9R1R0 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx6Q9R1R0 E130114P18Rik-201ENSMUST00000107067 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx6Q9R1R0 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx6Q9R1R0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx6Q9R1R0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx6Q9R1R0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx6Q9R1R0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx6Q9R1R0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx6Q9R1R0 CT009711.2-202ENSMUST00000224538 973 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lhx6Q9R1R0 AC160962.2-201ENSMUST00000224761 632 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lhx6Q9R1R0 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lhx6Q9R1R0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx6Q9R1R0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx6Q9R1R0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx6Q9R1R0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx6Q9R1R0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx6Q9R1R0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms