Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms