Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms