Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ88

Vps29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps29Q9QZ88 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms