Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXY6

Ehd3, EH domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ehd3Q9QXY6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ehd3Q9QXY6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms