Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms