Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms