Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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