Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PolkQ9QUG2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PolkQ9QUG2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PolkQ9QUG2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PolkQ9QUG2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PolkQ9QUG2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PolkQ9QUG2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PolkQ9QUG2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PolkQ9QUG2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PolkQ9QUG2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PolkQ9QUG2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PolkQ9QUG2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PolkQ9QUG2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PolkQ9QUG2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PolkQ9QUG2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PolkQ9QUG2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PolkQ9QUG2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PolkQ9QUG2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PolkQ9QUG2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PolkQ9QUG2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PolkQ9QUG2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PolkQ9QUG2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PolkQ9QUG2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PolkQ9QUG2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PolkQ9QUG2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PolkQ9QUG2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PolkQ9QUG2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PolkQ9QUG2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PolkQ9QUG2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PolkQ9QUG2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PolkQ9QUG2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PolkQ9QUG2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PolkQ9QUG2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PolkQ9QUG2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PolkQ9QUG2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PolkQ9QUG2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PolkQ9QUG2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PolkQ9QUG2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms