Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Hdgfl3Q9JMG7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Hdgfl3Q9JMG7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Hdgfl3Q9JMG7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Hdgfl3Q9JMG7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Hdgfl3Q9JMG7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Hdgfl3Q9JMG7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Hdgfl3Q9JMG7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Hdgfl3Q9JMG7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Hdgfl3Q9JMG7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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