Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SrfQ9JM73 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SrfQ9JM73 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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SrfQ9JM73 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
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SrfQ9JM73 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SrfQ9JM73 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SrfQ9JM73 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SrfQ9JM73 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SrfQ9JM73 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SrfQ9JM73 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SrfQ9JM73 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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